1.RRP15募集至DNA损伤位点的机制初探thesis_D03482188 [硕士论文]王仁欠吉细胞生物学上海师范大学2024
摘要：生物体内基因组 DNA 会受到内源生理或外源环境因素的影响而产生损伤。为维持染色体基因组的完整性，真核生物进化出一套保守的生理机制即DNA损伤反应（DNA Damage Response，DDR）以应对 DNA 损伤及其产生的后续影响。DNA 损伤反应机制的正常运作对于维持生物体的正常生命活动至关重要，当这一机制出现问题时，可能直接导致受损的基因组 DNA 得不到及时准确地修复，染色体基因组的
DNA损伤反应细胞调亡RRP15蛋白H2AX蛋白
2.基于深度学习和动态语义信息的基因组序列研究thesis_D03505613 [硕士论文]王岩松计算机科学与技术吉林大学2024
摘要：随着高通量测序技术和人工智能技术高速发展，海量基因组序列数据和数据驱动的机器学习算法层出不穷，为发现基因组序列中隐含规律和调控模式奠定了坚实基础。基因组序列中蕴含着许多遗传信息，其中，RNA 结合蛋白（RBPs）事件和 DNA 增强子片段在基因表达的不同阶段起着不同的作用。RBPs 事件能够对真核生物体内不同层面的生物通路产生影响，DNA 增强子则对基因表达水平起到增强作用。因此，探索并理解
基因组序列基因表达动态语义信息语义生成模型深度学习
3.目录UAP56/URH49以及突变体相互作用蛋白的鉴定thesis_D03177845 [硕士论文]王为民生物化学与分子生物学大连医科大学2023
摘要：目的：环状RNA（circular RNA）是一种新兴的内源性非编码RNA，是继microRNA （miRNA）和 long noncoding RNA（lncRNA）后非编码 RNA家族中极具研究潜力的新成员。大量研究表明，环状 RNA 具有种类多样、序列保守、结构稳定、以及细胞和组织特异性表达等重要特点。近年来，科学家在众多生物中发现了数量繁多的环状RNA，并且发现它们有着关键的生物学功能，
环状RNA转运出核机制UAP56蛋白URH49蛋白氨基酸基序突变体相互作用蛋白
4.目录基于染色质状态的 Cohesin 介导特异性环的识别研究thesis_D03169324 [硕士论文]郏然然数学;应用数学海南师范大学2023
摘要：Cohesin是一种高度保守的蛋白质复合物，广泛存在于真核生物中，在调节基因表达、基因组拓扑结构形成等方面起着重要作用，它介导的细胞类型特异性染色质环被认为在特异性的基因表达中发挥着关键作用。因此，研究该类型的染色质环对于理解基因表达调控机制、发展和维持不同细胞类型的特异性具有重要意义。相比于传统的生物学识别方法，机器学习算法可以减少更多的成本。本文通过多种机器学习算法的性能比较，建立了基于随机
染色质状态cohesin介导特异性染色质环随机森林机器学习
5.目录成骨细胞条件性PHB1基因敲除小鼠的构建及鉴定thesis_D03170682 [硕士论文]陈灼均药学广东医科大学2023
摘要：目的： 1.构建成骨细胞条件性PHB1基因敲除小鼠。 2.探讨成骨细胞敲除PHB1基因对小鼠生长发育的影响。 方法： 1.用Western blot实验检测4周龄和6月龄野生型C57BL/6J雌性小鼠股骨PHB1蛋白表达量，计算灰度值并进行统计分析。 2.通过CRISPR/Cas9技术，在小鼠PHB1基因第4~5外显子插入Loxp位点，构建带有Loxp位点的PHB1floxed小鼠
PHB1基因成骨细胞生长发育
6.目录基于汇总数据的基因变异与多元性状的关联分析thesis_Y4095655 [硕士论文]魏千然统计学黑龙江大学2023
摘要：全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study,GWAS）是在全基因组范围内对遗传变异进行检验，以发现与特定性状或复杂疾病显著关联的基因变异。然而这些变异只解释了大多数性状整体遗传力的一小部分，而联合分析多个性状能提高识别新的基因变异的功效，特别是多效性基因变异。另外，由于个体水平数据难以获得，而汇总数据通常是公开可用的，且关于各种性状的汇总数据日益增多，所以基于
基因变异多元性状自适应关联检验关联性
7.目录减数分裂时期细胞器的超微结构变化及polycomplex的原位结构thesis_Y4170284 [硕士论文]项悦皓生物化学与分子生物学中国科学技术大学2023
摘要：减数分裂是有性生殖生物的一种特殊的细胞分裂方式，对生物繁殖及遗传起着重要作用。联会复合体(Synaptonemalcomplex,SC)是减数第一次分裂前期同源染色体之间形成的蛋白质聚合物。它作为减数分裂的标志性结构可以为参与减数分裂的蛋白提供锚点，也可以介导与染色体行为相关的重要事件，如同源重组的发生、同源染色体间遗传物质的交换等。并且联会复合体是一个组成复杂且高度动态的生物大分子机器，还受到
减数分裂时期细胞器生理状态原位结构联会复合体
8.目录SRSF10调控染色体RNA滞留及Mago调控双向转录的研究thesis_D03201889 [硕士论文]姬钰生物学重庆大学2023
摘要：染色体（Chromosome）是染色质在有丝分裂和减数分裂时期的一种高度凝聚化的形态，这种高凝聚化状态更易于将遗传物质精确的分配到子细胞。染色体上也存在一定量的RNA，其对于染色体的凝聚和准确分配起着重要的作用。然而这些RNA是如何滞留在染色体上的，目前尚不清楚。 本文第一部分以Hela细胞为研究材料，通过对比染色体RNA和细胞核RNA测序数据，得到了特异性吸附于染色体的RNA子集，并分析得到
染色体RNA滞留SRSF10基因Mago蛋白双向转录调控机制
9.目录人类多组织单细胞表达图谱数据库HUSCH构建及分析thesis_D03232929 [硕士论文]于智光生物学广西大学2023
摘要：了解不同人类细胞类型的基因表达模式对于研究细胞类型分化、疾病发生和进展的机制至关重要。单细胞转录组测序（scRNA-seq) 技术的最新发展大大促进了不同人体组织中细胞类型异质性的表征。相较于传统的批量转录组测序（bulk RNA-seq) ，scRNA-seq能够在单细胞维度上揭示 同一时间下不同细胞之间表达的差异，因此得到了越来越广泛的应用。同时，随着单细胞测序技术逐渐发展，每年产生的数据
人类单细胞表达图谱数据库数据处理在线注释功能模块
10.目录贵州土家族和仡佬族人群23个常染色体STR基因座遗传多态性及遗传关系分析thesis_D03375151 [硕士论文]李淑华法医学遵义医科大学2023
摘要：目的： 调查贵州土家族和仡佬族人群23个常染色体STR基因座的遗传多态性，评估HuaxiaPlatinumTM试剂盒在贵州土家族和仡佬族人群中的法医学应用价值；分析贵州土家族和仡佬族人群与其它21个不同地理、民族和语系群体的遗传关系，为群体的历史起源、迁移和基因融合提供分子学角度的证据。 方法： （1）样品采集：采集贵州土家族和仡佬族无关健康个体480和490例。（2）STR分型：采用
短串联重复序列染色体STR遗传多态性遗传关系
11.126个AI--SNP位点的祖源推断效能及内蒙古满族群体遗传特征的探究thesis_Y4166187 [硕士论文]张蕴盈基础医学南方医科大学2023
摘要：背景与目的:单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是由基因组中单个核苷酸变异导致的DNA序列多态性，在法医祖源推断方面具有众多突出优势。目前，已有许多祖先信息SNP(ancestry-informative SNP,AI-SNP)体系被成功研发，这些体系大多包含经典体系中表现不错的AI-SNP位点，新的有潜能的位点仍有待挖掘。此外，寻求具有高分辨力
蒙古满族群体遗传特征单核苷酸多态性祖源推断效能
12.目录体外建立小鼠原始生殖细胞的诱导体系及其功能性研究thesis_D03368136 [硕士论文]郭爱林生物与医药内蒙古大学2023
摘要：两种生殖细胞的结合在哺乳动物生物体中是新个体的起源，也是遗传多样性的发生和进化的动力。其中原始生殖细胞（Primordial germ cell，PGC）是发育过程中形成的第一个生殖细胞群，是卵原细胞和精原细胞的直接前体。近年来，研究人员通过使用多能干细胞作为起始种子细胞，在体外成功重建了生殖细胞发育过程的模拟体系。然而，小鼠原始生殖细胞的体外生成效率仍然很低，这限制了生殖谱系细胞发育的深入研究
原始生殖细胞胶原蛋白层粘连蛋白纤连蛋白
13.目录不同多能性状态mESC自我更新调控基因的鉴定及功能研究thesis_D03240076 [硕士论文]王江骏细胞生物学陆军军医大学2023
摘要：小鼠胚胎干细胞（mouse embryonic stem cell,mESC）来源于囊胚中的内细胞团（inner cell mass,ICM），具有无限的自我更新能力及外、中、内三胚层分化潜能。正是由于mESC的这两种特性，使得其成为研究胚胎发育和疾病发生发展等的良好模型。既往研究已经揭示了外部信号通路（LIF/Stat3、Wnt/β-catenin、Fgf4/Mek/Erk等）和内源转录网络（
胚胎干细胞多能性状态自我更新调控基因基因鉴定基因功能
14.目录考虑群体结构的定量性状基因位点关联检验thesis_Y4367522 [硕士论文]万照欣统计学黑龙江大学2024
摘要：长期以来，群体分层问题一直是遗传关联研究领域的一个关键的挑战.这一问题源于不同人群之间遗传背景的差异，这种差异在统计分析中未被充分考虑时，可能会导致研究结果的偏差.具体来说，群体分层可能会导致研究中出现假阳性结果，即错误地将某些基因位点认定为与研究性状相关联，或者产生假阴性结果，即错过真正与性状相关的基因位点.如果这些问题不通过适当的统计方法或设计进行纠正，就可能掩盖掉真实的遗传关联信号，从而
基因关联分析定量性状群体结构线性回归模型罕见变异
15.目录基因组序列进化模式的演变及进化机制与核苷酸突变的关系thesis_Y4126941 [硕士论文]张蒙川物理学内蒙古大学2023
摘要：揭示基因组序列的进化机制是生物学的热点问题。基于基因组序列中16种XY子集8-mer频谱分布，前期研究发现15种非CG类子集8-mer频谱在灵长类动物中是多峰分布，在非脊椎动物中是单峰分布。但从单峰到多峰的转变以及所涉及的过渡物种仍不清楚。我们以294个动物和135个植物基因组序列为研究对象，研究了每个物种基因组序列中15种非CG类子集8-mer频谱的分布特征。结果表明，所有植物的XY子集8
基因组序列进化核苷酸突变8-mer频谱二核苷比率
16.目录3、22号染色体不平衡易位iPS模型构建及SHANK3基因的功能研究thesis_Y4360350 [硕士论文]牛莎莎儿科学山东大学2024
摘要：研究背景: 染色体结构和数目异常是导致神经系统发育障碍性疾病的重要原因，因其在人群中发病率高且致残率高而受到广泛关注，然而目前致病机制尚未完全阐明。在本课题组之前的研究中首次报道了 1个稳定遗传5代的3、22号染色体不平衡易位大家系，先证者及家系内其他患者均表现出严重的智力低下，在chr22q13.3区域有一个拷贝1.7Mb大小的片段缺失，该缺失覆盖了整个chr22q13.3远端的区域，包含与
染色体不平衡易位iPS模型SHANK3基因基因功能
17.目录斑马鱼血管系统的三维荧光成像技术研究thesis_Y4169091 [博士论文]陈冲生物医学工程中国科学技术大学2023
摘要：斑马鱼是一种重要的脊椎模式生物，因其繁殖率高、体外受精等特点而被广泛应用于血管生长机制和疾病的研究。更重要的是，斑马鱼在幼鱼阶段为半透明状态，因此可以使用光学成像的方法来定量地研究斑马鱼血管系统的发育过程，以及疾病对血管结构的影响等。 斑马鱼血管系统的成像方法可以分为结构成像和功能成像两大类，本论文致力于发展更适合于活体斑马鱼血管三维结构成像的技术。斑马鱼的心脏及周围血管始终处于快速运动状态，
斑马鱼血管系统三维荧光成像技术图像增强
18.目录基于多组学特征的YY1环锚定点预测thesis_D03169329 [硕士论文]任俊数学;应用数学海南师范大学2023
摘要：染色质是一种复杂的结构，对基因表达的调控起着关键作用。近年来，研究集中在染色质的三维组织以及它对基因表达的影响上。转录因子YY1已知能够促进增强子-启动子间的相互作用，类似于CTCF介导的染色质相互作用。YY1在基因表达和细胞命运决定中发挥着重要作用。然而，目前尚不清楚哪些YY1结合位点能够形成环锚点。 本研究使用LightGBM模型整合多组学数据（包括基因组、转录组和表观遗传学数据）来预测
转录因子YY1环锚点多组学特征DNA序列组蛋白修饰
19.目录基于患病祖孙对数据设计的定性性状关联检验thesis_Y4095652 [硕士论文]刘世哲统计学黑龙江大学2023
摘要：随着全基因组关联分析和测序技术的不断发展，越来越多的与复杂性状相关的变异被检测出来，其中，包括罕见变异和常见变异.研究表明，复杂疾病不是单纯由常见变异或者罕见变异引起的，而是在罕见变异和常见变异共同作用下所导致的.因此，在遗传统计学中，将复杂疾病与遗传变异中的罕见变异和常见变异相结合进行研究是较为有效的方法.近年来，以家庭数据为基础的研究获得了很大的关注度，但一般只在关系较亲的同胞对上做研究，
遗传统计学复杂疾病基因变异定性性状
20.肝癌细胞中环状RNA作为竞争性内源RNA调控基因表达的网络鉴定和实验验证thesis_D03663012 [硕士论文]孙德辉生物学东北林业大学2024
癌细胞环状竞争性调控基因表达网络鉴定实验验证
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